コップの中の水

　遅々として進まず。

　という表現がありますが、最近、身の回りでは『遅々ながらも』進捗中、なものが多く目に入る気がします。

　コップに半分はいった水を見て、『半分はいってる♪』と思うか、『半分しか無い....』と思うか、という表現がありますが、私は、『実験/研究とはうまく行かないのが普通』と思い込んでいるところがあるので、遅くても進展が見えると嬉しい気分が先に立ちます。

　年の初めに出してみた論文、これじゃいろいろ足りないよ、といわれて返ってきたので、それではデータを足してよい論文にいたしましょう、と計画。そこからが長かった。ああだこうだと試行錯誤をしているうちに、夏が終わり、秋も終わりの今頃になって、やっとのことでうまく行かなかった原因が分かった気がします。Hさんの着実ながんばりに感謝です。
　長いことスタックするのは癪に触りますが、問題解決することで、小さいながら新しいネタを見つけたような気もしますし、なにより、頭のうえにどしんと乗っかっていたギモンがするりと解けたのはよいことです。スッキリしたね〜、とHさんと話しています。

　一方で、ウイルスゲノム。こちらも少しずつ進展中。今後の研究の基礎になる物だし、完成する前から興味を示してくれる人もいるし、こちらももうひと頑張り、仕上げを目指します。

　等といっている間に、やはり進行中の新棟建築。
　基礎のコンクリートが流し込まれました。今の眺めはこんな感じ。
　

土台のコンクリートが流し込まれ..........

枠が取り去られたらこんな感じ。更地とは大変な違いです。

　更地になるまで、結構な時間がかかった気がするのですが、一度きれいに平らにされたら、こちらはずいぶん急展開です。下地を整えるまでが一番大変ってことかしら、あるところまでいったら、後は急展開できるのね♪と、都合良く解釈して、私たちも年末に向けてもうひと仕事ですね。

年末まで６週間

　あと10日で11月が終わります…。

　このブログを読み返しても、1月2月の記事は、ついこの間のことを書いているような気がするのに、あっという間に年末が射程範囲内です。

　この分だと、あっという間に年度末が目にはいりますね。カレンダーを見ては、ひやりとするこのごろ。

　さて、ウイルスゲノム。

　次世代シークエンス技術を持ってしても、一気に1本につながった結果を得ることはできませんでしたので、何本かに分かれたゲノムの断片をつなぎ合わせるパズルを解いています。

　長いExtensionが必要なPCRを毎晩かけて、朝になったら、出来上がった産物を電気泳動。これまでの実験で明らかになった断片配列同士をつなぎ合わせる部分を増幅して、サンガー法で配列を読もうというわけです。

　遺伝子のクローニングはこれまで数多く手がけてきましたが、ここまで大きいものをつなぐという作業は初めて。きれいにつながって行く経過が、単純に愉しいものです。

……なんていっていられたのは、実は半分つなげるまで。
半分はさくっとつながり、さて、後半分をつなげようとして、ううむ。うまく行かない…。
ショートリードをアセンブルして得た『ドラフトもドラフト』な情報に基づいているので、もちろん間違いだって含まれていておかしくはない。というわけで、後半を終わらせるには、つながっていない断片の配列、ことに両端近くの配列を疑ってかからないといけないようです。

それにしても、最近、プライマーの合成が早くなりましたね。
朝早くに注文すると、うまく行けば翌日夕方までには届いたりします。
実験が進まない言い訳がどんどん少なくなる…とはいえ、今みたいに試行錯誤を繰り返すような実験では、使いたいと思ったらさっと届くのはやはり助かりますね。

　試行錯誤に頭を悩ませる最中ではありますが、途中までつながったものを、幾つか簡単な方法で解析して、どんな遺伝子が乗っているかを調べてみると、信頼性が高い情報が得られている手応えがあって、ウレシイ。
　はやく全長の解析を終わらせたいものです。

急ピッチ！

　あと1ヶ月半で今年も終わり。早いものです。

　先週返ってきたウイルスの配列の委託解読。

　配列を解読したファイルを送ってもらい、それを自分で解析＝ショートリードのファイルを処理してつなげようとしていた訳です。改良点はあれど、結構長い配列までつながり、未知ながら既存の遺伝子配列に相同性があるものが結構のっているのが分かりました。

　こういうのって、気分があがりますね。

　足さなければならない実験は沢山あるのですが、それでも確かに一歩踏み出している、という感覚は大変うれしいものです。

　以前教えていただいた解析方法で、自分でできるところまではなんとか終えましたが、しかし、長いのはここから。この手の仕事に初心者にとって強い見方、統合TVと首っ引きです。

　と、PCに向かうこのごろですが、一方で例の増改築工事が着々と進んでいます。
　NZ出張の前には、地ならしが終わったぐらいだったのですが。
　現在は、こんなふう。

　建物の解体にずいぶん時間がかかっていたような気がして、来年春の完成は無理っぽい？、などと思っていたのですが、とんでもない。
　大げさではなく、毎朝見に行くと何かしらの進捗が目に留まります。
　来年春には新棟完成か！そちらも気分があがります♪

　

　

Back to school

　さて、国際学会も終わり帰国、そして日常生活に復帰しました。

　米国で、特に夏の終わりに、長い夏休みが終わって、気を引き締めて新学期開始！というのを、Back to schoolと表していましたが、まさにそんな気分。

　発表は、おかげさまで、無事終了。単に問題なし、というよりは、好意的に、興味を持って受け取っていただけた気がします。

　ありがたかったのは、『こんなことをやったら面白いんじゃないかな、でも、一人だと無理だな…』と思っていたアイディアを、サポートしてあげるよ、といってくださる方々と出会えたこと。

　こんな風に話が進むって、直接顔をあわせて、何日間か楽しく過ごした相手とだけ可能になることです。一日限り、日帰り研究会などだと、初対面の人とここまで話を詰めるのは、むずかしいですよね。そして、見渡すかぎり日本人だけ、という、日本の学会でよりも、世界各国から集まった人々の中に少数の日本人、というセッティングの国際学会の方が、より密度の高いコミュニケーションが可能になる感じ。逆説的ですが。

　長い目で見て、一番いい方策を探るためにも、まずは、あちらの施設を見学にいったり、もう少しじっくり話し合ったりしましょう、ということで帰国しました。

　こういう『新しい見通し』って、スーツケースには入れられない、貴重なお土産です。

　というわけで、気分よく帰着した第一日目に、待ちに待ったウイルスゲノムの解読結果が届きました。

　これを自分で解析できるようになるために、例のBootcampにお邪魔したわけです。

　おそるおそるやってみたら、おお、自分でもある程度解析できた！

　教えていただいたことを、そのままコピペにちかい操作をしているわけで、できるのが当たり前なのですが、でもウレシイ♪

　最終的に必要な情報の完備まではまだ道のりがありますが、重要な基礎は得た感じ。嬉しい滑り出しの一週間でした。

　常にこういけば、研究もいつもいつも愉しいものになるのになぁ……笑。

　

　

@International Conference of Harmful Algae

　訳してみたら、『国際有害藻類学会』でしょうか。

　いってきました、ウェリントン・ニュージーランド。月曜日朝から金曜日夕方まで、５日間ぎっちりと世界のあちこちで問題を起こしている有害な藻に関する学会です。
　約400人の参加者が会した学会でした。大きい会のように感じましたが、実はもっと大きかったことも有るということで、今回は南半球での開催ということで出席を見合わせた人も結構いるようです。

　確かに、北米東海岸や、欧州からは、オセアニアって、本当に遠い。シドニーならばまだしも、さらにそこからもうひと飛びしなければならないとなると、出席が苦しい人もたくさんいたかもしれませんね。

　赤潮・青潮は、浅海域・淡水湖が有るところでは、あまねく大きな問題なようです。
という、この学会に昔から所属する人からは失笑を買いそうな初歩的なことも、私にとっては耳新しかったりします。この学会で、一番多くの参加者を引きつけているのは毒性物質とその合成に関与する遺伝子に関するトピックでしょうか。赤潮・青潮の多くは、魚介類に毒性がある物質を生産したり、あるいは赤潮・青潮由来の魚介類に蓄積された物質を人間が摂取することで健康被害が出たりすることで『害藻』と認識されている訳です。となると、やはりこれらが『花形トピック』となりますね。

　さて、この学会に参加したのは、自分の発表をするため、にくわえて、『この分野の研究者の顔を見に行くため』。
　とくに、例えば発表に対する質問の仕方などで、その研究者がどんな方なのか？というのが何となくにじみ出たりします。たとえば、論文を発表したいときに、査読者としてお願いしたい人（避けたい人）を選ぶ段に、そういう情報があるというのはなんとなく心強いんですよね。
　世界がいくらインターネットで結ばれても、やっぱり本当にその場にいかないとわかりにくいことって、あるものです。

　そして、今回はこの分野のものとしては私に取っては初めて参加する学会だったので、まずは、他の日本人の参加者とお近づきになりたいともおもっていました。発表以外の、これら『隠された目的』もおかげさまで達成できている気がします。

　なんて鷹揚なことを言っていますが、今回の私の発表は最終日。この記事がアップされて数時間後に順番が回ってきます。もうちょっと、発表練習しようっと（笑。

会議場前の港から見える風景。海沿いの待ちながら、山地と呼ぶには

低く、丘陵地と呼ぶには険しい地形に囲まれています。風が強く天気が変わ

りやすいのに驚きましたが、晴れたときには本当にすてきです。

学会会場前に飾られていたオブジェ。シダの

透かし模様が繊細できれい。ニュージーラン

ド人の美的感覚って、日本人の好みにとても近

い気がしました。

石の上にも3年

　来週から、ニュージーランドで開催される国際学会に出席して参ります。

　自分と同年代の研究者仲間を見ていると、みな、１年に2回は国際学会で発表し、国内の学会は、人によっては５つぐらい回る、というのが普通に見えますが、私は、いわゆる国際学会は3年ぶり。

　3年前、急ハンドル切って研究のトピックをヘテロシグマに替えてから、発表できる状態に持ってくるのに、これだけ時間がかかった訳です。

　とはいえ、まさに五里霧中な状態から、あれもやりたいこれもやりたい人手が足りない研究費も欲しい、という状態にまで来れたのは、とても嬉しい、ありがたいことです。

　ヘテロシグマの研究をする！と言い出したころには、周りの反応は『？？？』というものでしたが、最近興味を持ってくれる方も増えてきて、そういう人たちとのおしゃべりから、さらにネットワークが広がって……。と、とてもいい感じ。

　何にも無かったラボ開設一日目から3年経ったんだもんね、と思う機会が増えている訳ですが、考えてみれば、これぞまさに『石の上にも3年』ということなのかもしれません。

　昔の人は、やっぱり賢い（笑）。

　というわけで、８泊９日の旅にいってまいります。

　実は、学会大好き、国際学会はもっとすき、なので、嬉しくて仕方がありません。

　ただ今、旅支度…発表準備、荷物の準備、いない間にHさんにお願いする仕事の打ち合わせ、帰ってきてからの準備に、行く前に終わらせなければならない実験に書類仕事の数々に…と駆け回っております。飛行機に乗ったら、どっときそうですね（笑。

　

　

台風一過

　ずいぶんよく降った3連休でしたね。
岡山県、特に岡山南部は、『晴れの国』を自称していますが、確かに雨の日が少ない（今年の夏は、例外的に多かったですが）。加えて、中国山地と四国山地に挟まれた地形のせいか、台風がそれる傾向にあるのですが、今回は、ちゃんと直撃してくれました。

　3年ほど前にオープンした倉敷駅前のアウトレットモールが、台風の影響でなんと、休日午後2時で閉店。とはいえ、万全の構え（？）のおかげでか、県下での被害は少なく済んだようです。

　さて、個人的に、旅が多い今年の秋。
　まず、宮崎大学にBootcampにお邪魔したのを皮切りに、九大農学部に共同研究者からご紹介いただいて特別講義を聴講にお邪魔し、これもしっかり勉強させていただきました。
　今週末は、将来の共同研究を夢見て勉強会に出席、そして、来週末からは、ヘテロシグマについての私たちにとっては初の発表をしに学会@ニュージーランド。
　仕事が立ち上がってくるのと同期して、他大学の研究者との交流も増えてきて、とても健全な感じがしています。

　あっちに行ったりこっちに行ったり、加えてこの秋は研究所の100周年があり、それとは別件で研究所の国際交流イベントあり、バックグラウンドでは、恒例の科研費シーズン、と、なんだか落ち着きませんが、実験もしたい。

　特に、科研費を書いていると、あんなことやりたい、こんなことおもしろそう、と、夢が広がって、ついつい、将来の仕事のはずをいまから着手したりしてしまいます。本末転倒な気もしますが、アカデミアの研究って、楽しい、面白いが言動力よね？をいいわけに、とりあえず今月末の海外出張までにできるだけのことを終わらせようと動きまわっている毎日です。